Le gouvernement général de Madagascar est une colonie française ayant existé de 1897 à 1946, avant de devenir un territoire d’outre-mer. Cette colonie était constituée de Madagascar et d’autres territoires sous souveraineté française, qualifiés de dépendances. Désirant poursuivre la colonisation dans l’archipel, la France, à travers ses administrateurs basés à Mayotte, se donne les moyens de contrôler davantage les Comores. En Avril 1908, elle fait rattacher, de manière formelle, les quatre îles (Mayotte, Mwali, Ndzuani et Ngazidja) au gouvernement général de Madagascar. Depuis, les Comores appartiennent à la colonie de « Madagascar et dépendances ». Ce rattachement sera officialisé par une loi française du 25 juillet 1912.

Grâce à l’action politique du docteur Said Mohamed Cheikh, les Comores obtiennent un détachement de Madagascar et bénéficient, en 1946, une autonomie administrative, avec Dzaoudzi comme capitale du nouveau territoire. Pour la première fois, l’archipel sera représenté à l’assemblée nationale française, par le député Said Mohamed Cheikh.